Договор поставки

Здравствуйте, подскажите пожалуйста ответ на вопрос, Организация поставщик поставляет товар другой организации, те в свою очередь оплачивают товар по накладным,но оплачиват с просрочкой платежа, в договоре установлена пеня в размере 0,2% от стоимости неоплаченной партии товара, подскажите как считать пеню? По акту сверки с покупателем у них есть начальное сальдо, но ведь когда они погашают задолженность по накладным они автоматически гасят сальдо? как посчитать сумму долга? Пеня расчитывается по каждой накладной?